On considère que les voies respiratoires d'un sujet sain non fumeur sont stériles.
En fait il y existe une flore bactérienne très semblable de celle des voies aériennes sus-glottiques mais à des concentrations très inférieures et qui diminuent de la glotte à l'alvéole.
On considère que la contamination se fait par micro-aspirations.
Réf : Charlson ES, Bittinger K, Haas AR, Fitzgerald AS, Frank I et al. Topographical continuity of bacterial populations in the healthy human respiratory tract. Am J Respir Crit Care Med 2011;184:957-63
Expectoration
(examen cytobactériologique des crachats : ECBC)